CI提供了钩子这种特性，可以在不修改核心文件的情况下用来修改框架内部执行流程。

全局来看，是否开启钩子可以在APPPATH/config/config.php中进行修改，而hooks的配置则在APPPATH/config/hooks.php中进行定义，具体如何实现可以参考官方文档：http://codeigniter.org.cn/user_guide/general/hooks.html?highlight=hooks

这里简单讲一下hooks的定义方式，有助于后面的源码理解。
第一种定义方式，使用数组定义的形式：

$hook['pre_controller'] = array(
    'class'    => 'MyClass',
    'function' => 'Myfunction',
    'filename' => 'Myclass.php',
    'filepath' => 'hooks',
    'params'   => array('beer', 'wine', 'snacks')
);

另一种出现在PHP5.3以后，可以使用lambda的闭包或是匿名函数作为钩子：

$hook['post_controller'] = function()
{
    /* do something here */
};

如果想在同一个挂钩点添加多个钩子，将其改为二维数组即可。看一下Hooks.php的精简版代码，具体的解析写在了代码的注释中。

<?php

defined('BASEPATH') OR exit('No direct script access allowed');

class CI_Hooks {
    // 钩子是否启用
    public $enabled = FALSE;
    // 所有的hook数组
    public $hooks =    array();
    // 存储hooks的类
    protected $_objects = array();
    // 运行标志，防止死循环
    protected $_in_progress = FALSE;

    public function __construct()
    {
        // 加载配置文件
        $CFG =& load_class('Config', 'core');
        log_message('info', 'Hooks Class Initialized');

        // 检测配置文件中是否存在enable_hooks选项，没有的话直接返回
        if ($CFG->item('enable_hooks') === FALSE)
        {
            return;
        }

        // 查找hooks文件
        if (file_exists(APPPATH.'config/hooks.php'))
        {
            include(APPPATH.'config/hooks.php');
        }
 
        if (file_exists(APPPATH.'config/'.ENVIRONMENT.'/hooks.php'))
        {
            include(APPPATH.'config/'.ENVIRONMENT.'/hooks.php');
        }

        // 没有hooks，结束。
        if ( ! isset($hook) OR ! is_array($hook))
        {
            return;
        }
 
        // 更改相关状态
        $this->hooks =& $hook;
        $this->enabled = TRUE;
    }

    public function call_hook($which = '')
    {
        // 如果hooks没有启用，或没有传入合法的hooks，返回FALSE
        if ( ! $this->enabled OR ! isset($this->hooks[$which]))
        {
            return FALSE;
        }
         // 如果hooks的定义方式为数组，并且没有指定function的时候，依次运行
        if (is_array($this->hooks[$which]) && ! isset($this->hooks[$which]['function']))
        {
            foreach ($this->hooks[$which] as $val)
            {
                $this->_run_hook($val);
            }
        }
        else    // 对于PHP5.3以上，采用匿名函数的时候进入else分支
        {
            $this->_run_hook($this->hooks[$which]);
        }
 
        return TRUE;
    }

    protected function _run_hook($data)
    {
        // 检测参数是否可调用
        if (is_callable($data))
        {
            is_array($data)
                ? $data[0]->{$data[1]}()
                : $data();
 
            return TRUE;
        }
        elseif ( ! is_array($data))
        {
            // 如果不可调用、也不是数组，返回FALSE
            return FALSE;
        }
        
        // 如果正在运行，则返回
        if ($this->_in_progress === TRUE)
        {
            return;
        }

        // 检查是否设置了相关文件名和路径
        if ( ! isset($data['filepath'], $data['filename']))
        {
            return FALSE;
        }
 
        // 连接路径
        $filepath = APPPATH.$data['filepath'].'/'.$data['filename'];
 
        // 检测文件合法性
        if ( ! file_exists($filepath))
        {
            return FALSE;
        }
 
        // Determine and class and/or function names
        $class        = empty($data['class']) ? FALSE : $data['class'];
        $function    = empty($data['function']) ? FALSE : $data['function'];
        $params        = isset($data['params']) ? $data['params'] : '';
 
        if (empty($function))
        {
            return FALSE;
        }
 
        // Set the _in_progress flag
        $this->_in_progress = TRUE;
 
        // Call the requested class and/or function
        if ($class !== FALSE)
        {
            // The object is stored?
            if (isset($this->_objects[$class]))
            {
                if (method_exists($this->_objects[$class], $function))
                {
                    $this->_objects[$class]->$function($params);
                }
                else
                {
                    return $this->_in_progress = FALSE;
                }
            }
            else
            {
                class_exists($class, FALSE) OR require_once($filepath);
 
                if ( ! class_exists($class, FALSE) OR ! method_exists($class, $function))
                {
                    return $this->_in_progress = FALSE;
                }
 
                // Store the object and execute the method
                $this->_objects[$class] = new $class();
                $this->_objects[$class]->$function($params);
            }
        }
        else
        {
            function_exists($function) OR require_once($filepath);
 
            if ( ! function_exists($function))
            {
                return $this->_in_progress = FALSE;
            }
 
            $function($params);
        }
 
        $this->_in_progress = FALSE;
        return TRUE;
    }
 
}

结合注释来看，整体比较简单。